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  当时商业化育种面对两大问题：一是育种的商业性和公益性在实践中难以区别，科研院所退出商业化育种范畴存在实际困难；二是受传统育种科研系统限制，民族种企短期内还难以扮演种业立异的主体人物。

  以企业为主体的商业化育种新机制施行两年来开展缓慢。两会期间，来自种业界的一些全国人大代表在剖析原因时指出，当时商业化育种面对两大问题：一是育种的商业性和公益性在实践中难以区别，科研院所退出商业化育种范畴存在实际困难；二是受传统育种科研系统限制，民族种企短期内还难以扮演种业立异的主体人物。

  2011年，国务院颁布的《关于快速推动现代农作物种业开展的定见》提出树立以种子企业为主体的商业化育种机制，要求科研院校退出商业化育种范畴，转向公益性和基础性研讨。

  全国人大代表、河南农科院小麦研讨所所长许为刚说，《定见》进行这样的功用区别，初衷是未处理科研系统存在的坏处，加速开展我国种业，应对国外种企盛气凌人的态势，这种区别契合世界潮流，对种业开展是必要的。但是在实践中，育种的商业性和公益性难以区别。育种是以产品发明为方针的应用科学，公益性和商业性之间有必定联系。更重要的是，现代生物育种不仅是要提醒某种自然规律，并且还要取得知识产权。能够想象，假设没有知识产权，将来搞育种就会面对无米之炊的为难局势。在这个意义上，基础性研讨又是商业性研讨。

  除了育种科学自身的特殊性外，根据我国种企整体实力落后的现状，一些代表以为，民族种企要承当起育种立异主体的重担需要时日。全国人大代表、安徽省宿州农科院副研讨员杨杰表明，做大、做强企业是国家针对国外种企逐渐占据我国商场的严峻局势而采纳的科学办法，但因我国多年来育种作业一向由科研院所承当，种企仅担任商场出售，假如科研院所现在彻底从商业化育种范畴退出，种企短期内难以生长为立异主体。

  全国人大代表、冠丰种业董事长刚才臣则以为，树立以企业为主体、以商场为导向、产学研相结合的技术立异系统是未来种业开展的必定方向，而要让企业成为立异主体，关键是要制定政策，让资金、项目和人才向企业活动。他说，现在社会有一种欠好的现象，便是我们都不乐意到企业来，而在国外，许多顶级人才都会集在企业。以美国孟山都为例，一个企业具有两位诺贝尔奖取得者。此外，他还主张，政府在资金扶持上不能像曩昔撒胡椒面似的八面玲珑，要要点投进，由于涣散只能带来低水平的重复，难以将种业做精、做细。

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